Conception in silico de nouveaux dérivés du benzimidazole et étude de leur affinité pour l’histone désacétylase 1 (HDAC1)

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2023-07-02

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Université Mouloud Mammeri TIZI OUZOU FACULTE DE MEDECINE Département de Pharmacie

Abstract

Le benzimidazole est un composé organique hétérocyclique. Il s'agit d'une structure qui occupe une place importante en chimie thérapeutique et révèle un grand intérêt dans la recherche de nouvelles molécules bioactives. En particulier, ce noyau constitue un pharmacophore de base pour la conception de nouvelles molécules antitumorales. Dans notre travail, nous nous sommes intéressées à la conception de deux séries de nouvelles molécules inhibitrices probable de HDAC1 (5ICN). La première série renfermant sept composés P1, P2, P3, P4, P5, P6 et P7 en s’inspirant du pracinostat (inhibiteur de HDAC1) et la deuxième série composée de huit molécules M1, M2, M3, M4, M5, M6, M7 et M8 en s’inspirant du mebendazole (ayant dans sa structure le noyau benzimidazole). Un docking moléculaire a été réalisé pour les molécules des deux séries grâce au logiciel Autodock Vina (ADV). Une étude, in silico, des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et toxicité par l’intermédiaire du serveur SwissADME et admetSar respectivement a été effectuée. Notre étude a été complétée par l’évaluation de la réactivité chimique des molécules proposées à l'aide de la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT). Les deux composés m7 et p7 ont donné les meilleurs scores d’affinité (-9.3, -8.6) comparé aux autres molécules et la référence ainsi qu’un bon profil pharmacocinétique et physicochimique et une réactivité chimique acceptable.

Description

Keywords

Benzimidazole, Anti-tumorale, HDAC1, Docking moléculaire, DFT

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