Browsing by Author "SI TAYEB Thiziri"

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    Modélisation par homologie et Docking protéine-protéine d’une métalloprotéinase hémorragique CcMP-II
    (Université Mouloud Mammeri TIZI OUZOU FACULTE DE MEDECINE Département de Pharmacie, 2024-06-25) MOUSSOUNI Katia; SAHI Hayet; SI TAYEB Thiziri; BELAZOUGUI Ourdia
    La biologie structurale étudie le lien entre la structure des molécules et leurs activités biologiques. La connaissance des structures des complexes protéine-protéine permet de mieux comprendre les mécanismes des interactions biomoléculaires. Cette étude vise à valider les prédictions du docking moléculaire et à démontrer son utilité dans l’élucidation d’un mécanisme de toxicité lié à une Snake venom metalloproteinase (SVMP), en comparant ces résultats avec ceux obtenus expérimentalement. Nous avons étudié l’interaction de Cerastes cerastes métalloproteinase type II (CcMP-II), une métalloprotéinase hémorragique du venin de serpent Cerastes cerastes, avec le collagène de type IV et l’intégrine alpha-2 beta-1 en utilisant le logiciel de docking moléculaire « HADDOCK ». Une modélisation par homologie a été réalisée au préalable, car la structure tridimensionnelle de la protéine n’était pas disponible dans la Protein DATA BANK (PDB). L’évaluation des complexes dockés a révélé des interactions favorables entre les deux protéines et des valeurs énergétiques significatives, suggérant des liaisons potentiellement fonctionnelles. La concordance des résultats in silico avec les données expérimentales valide cette approche et encourage l'intégration synergétique des deux méthodes pour comprendre les interactions biologiques complexes.