Modélisation par homologie et Docking protéine-protéine d’une métalloprotéinase hémorragique CcMP-II
Loading...
Date
2024-06-25
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Université Mouloud Mammeri TIZI OUZOU FACULTE DE MEDECINE Département de Pharmacie
Abstract
La biologie structurale étudie le lien
entre la structure des molécules et leurs activités
biologiques. La connaissance des structures des
complexes protéine-protéine permet de mieux
comprendre les mécanismes des interactions
biomoléculaires. Cette étude vise à valider les
prédictions du docking moléculaire et à
démontrer son utilité dans l’élucidation d’un
mécanisme de toxicité lié à une Snake venom
metalloproteinase (SVMP), en comparant ces
résultats avec ceux obtenus expérimentalement.
Nous avons étudié l’interaction de Cerastes
cerastes métalloproteinase type II (CcMP-II), une
métalloprotéinase hémorragique du venin de
serpent Cerastes cerastes, avec le collagène de
type IV et l’intégrine alpha-2 beta-1 en utilisant
le logiciel de docking moléculaire « HADDOCK
». Une modélisation par homologie a été réalisée
au préalable, car la structure tridimensionnelle de
la protéine n’était pas disponible dans la Protein
DATA BANK (PDB). L’évaluation des
complexes dockés a révélé des interactions
favorables entre les deux protéines et des valeurs
énergétiques significatives, suggérant des liaisons
potentiellement fonctionnelles. La concordance
des résultats in silico avec les données
expérimentales valide cette approche et
encourage l'intégration synergétique des deux
méthodes pour comprendre les interactions
biologiques complexes.
Description
Keywords
Docking moléculaire, Modélisation (homologie), Docking protéine-protéine, Métalloprotéinase hémorragique CcMP-II