Etude de mode de liaison de guanosine diphosphate et guanosine triphosphate avec l’Arf1, protéine impliquée dans le cancer du sein, en présence et en absence de Mg2+
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Date
2016
Authors
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Publisher
UMMTO
Abstract
L’ADP ribosylation factor1 (Arf1) est une petite protéine G localisée au niveau de
l’appareil de Golgi où elle exerce plusieurs fonctions homéostatiques comme le transport
vésiculaire. Contrairement aux autres membres de cette famille de petites protéines G, Arf1
est surexprimée dans les cellules invasives du cancer du sein et elle est impliquée dans la
migration et la prolifération des cellules cancéreuses. Ainsi, Arf1 constitue une cible
potentielle dans le traitement anti-cancer du sein.
L’objectif principal de notre travail est d’étudier le mode de liaison des deux ligands,
GTP et GDP, avec les résidus du site de liaison de l’Arf1 en présence et en absence de l’ion
Mg2+. Cette étude est réalisée à l’aide d’une technique de la modélisation moléculaire basée
sur la cible biologique, en l’occurrence le docking moléculaire.
Les résultats de la présente étude, qui sont en parfait accord avec les résultats de la
littérature, montrent que l’ion Mg2+ favorise l’interaction des ligands GTP et GDP aux résidus
tapissant le site actif de la protéine en particulier ASP93, ASP96 et THR31. Nous pouvons
dire que cette étude constitue un outil potentiel dans la compréhension du mécanisme
d’activation et d’inactivation de la protéine Arf1
Description
53f. : ill. en coul. ; 30cm+(CD-ROM)
Keywords
GDP, Arf1, Docking moléculaire, Anti-cancer